Cuando estamos usando OneDrive para Empresas para el almacenamiento de archivos de todo tipo, tenemos que tener en cuenta que estos se van a almacenar finalmente en SharePoint Online lo que implica que hay ciertos tipos de archivos bloqueados por defecto por la plataforma y que por lo tanto no van a poder ser guardados en OneDrive para Empresas bien sea por carga directa en el sitio o bien porque estamos haciendo una sincronización de archivos con el cliente de sincronización. En cuanto a qué tipos de archivos no están permitidos en OneDrive para Empresas, las siguientes referencias contienen toda la información al respecto:
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